
在非小细胞肺癌(NSCLC)等多种肿瘤中,甲硫腺苷磷酸化酶(MTAP)基因缺失(MTAP-del)常与相邻的抑癌基因 CDKN2A 缺失(CDKN2A-del)同时存在,并与患者生存预后较差相关。针对 MTAP-del,可使用 PRMT5 和 MAT2A 抑制剂通过「合成致死」机制进行靶向干预,但其与包括表皮生长因子受体(EGFR)在内的致癌驱动基因的共存情况及临床意义尚未得到充分研究[1]。
近期,由美国纪念斯隆凯特琳癌症中心Kathryn C. Arbour教授领衔的一项研究成果,在国际肺癌研究协会(IASLC)官方期刊《Journal of Thoracic Oncology》重磅发表。该研究通过分析近 5000 例 NSCLC 患者肿瘤样本,报告了携带 MTAP-del NSCLC 患者的基因组景观,揭示 MTAP-del 在 NSCLC 中相对常见(发生率 10%),常与致癌驱动基因变异(EGFR 突变最为常见)共存,并且可能在奥希替尼耐药后出现[1]。
基因组景观与基线特征
研究者通过二代测序(NGS)分析了 4926 例 NSCLC 患者的肿瘤样本,并采用基于拷贝数的方法评估了 MTAP-del 发生率。
结果发现,在所有患者肿瘤样本中,有 475 例(约 10%)存在 MTAP-del,674 例(约 14%)存在 CDKN2A-del;71% CDKN2A-del 肿瘤同时存在 MTAP-del。同时研究者指出,MTAP-del 在 NSCLC 中占比显著,相较 ALK 融合或 MET 14 号外显子跳跃突变等其他可靶向的基因变异更为常见。
在 MTAP-del 队列,除 CDKN2A/MTAP 共缺失最常见之外,EGFR 突变与 TERT 扩增的发生率也较高;而在 MTAP 野生型(MTAP-WT)队列,KRAS 突变与 RB1 突变较常见(图 1B)。
在 258 例 Ⅳ 期 MTAP-del NSCLC 肿瘤样本中,有 83%(214 例)同时存在致癌驱动基因变异,其中 EGFR 突变最为常见(占 MTAP-del 肿瘤的 48%),其次是 KRAS 突变(16%)与 ALK 融合(7%;图 1C)。另外,在诊断时检出 MTAP-del 的患者中,77% 存在致癌驱动基因变异,包括 39% 患者存在 EGFR 突变。

图 1.(A)NSCLC 样本中 CDKN2A 和/或 MTAP 缺失的重叠情况。(B)MTAP 缺失队列与 MTAP 野生型队列之间变异频率存在统计学显著差异的基因。(C)在 258 例 Ⅳ 期 MTAP 缺失 NSCLC 患者中共存致癌驱动基因变异的发生率。
与 MTAP-WT 队列相比,MTAP-del 队列从不吸烟者更多,并且脑转移发生率更高。
表1. MTAP-del 队列与MTAP-WT 队列的基线特征

MTAP 缺失对 EGFR 突变肺癌临床结局的影响
基线 MTAP-del 与奥希替尼治疗的至停药时间缩短相关
为探究 CDKN2A/MTAP 共缺失对 EGFR 突变 NSCLC 治疗反应的潜在影响,研究者针对基线 MTAP-del 型与 MTAP-WT 型的 Ⅳ 期 EGFR 经典突变(19del 或 L858R)NSCLC 患者的一线奥希替尼单药治疗结果进行了分析。
结果发现,所有 MTAP-del 患者(36 例)均存在 CDKN2A-del;而在 MTAP-WT患者(129 例)中,仅少数(5 例)存在 CDKN2A-del,但存在 EGFR L858R 突变的比例较高。与奥希替尼疗效较差相关的其他基线特征,包括 p53/RB1 共突变、脑/软脑膜转移,在两组之间基本均衡。
与 MTAP-WT 队列相比,MTAP-del 队列奥希替尼单药治疗的中位至停药时间(TTD)更短(19.0 个月 vs 24.9 个月,HR = 1.8,P = 0.01)。不过,两队列之间的总生存期(OS)差异无统计学意义(38.4 个月 vs 40.5 个月,HR = 1.7,P = 0.1)。
MTAP-del 可见于 EGFR 突变 NSCLC 患者病程的不同时间点,治疗后出现占 20%
为了解 EGFR 突变肺癌自然病程中 CDKN2A/MTAP 共缺失发生的时间,研究者针对 258 例 Ⅳ 期 MTAP-del NSCLC 患者中同时携带 EGFR 突变患者亚组进行了分析。
结果发现,有 123 例 Ⅳ 期 EGFR 突变 NSCLC 患者在临床病程的某一阶段被检出 MTAP-del:63 例(51%)在诊断时即存在;25 例(20%)在治疗后出现;35 例(29%)出现时间未知。其中,15 例在 EGFR-TKI 单药治疗后出现 MTAP-del,10 例在 EGFR-TKI 联合化疗 ± 免疫治疗后出现 MTAP-del。
在奥希替尼获得性耐药中, CDKN2A/MTAP 共缺失发生率为 13%
为明确 CDKN2A/MTAP 共缺失在奥希替尼获得性耐药中的发生频率,研究者针对 69 例基线时为 MTAP-WT、具有奥希替尼治疗前后配对组织 NGS 样本的 Ⅳ 期 EGFR 突变(包括非经典突变)NSCLC 患者进行分析。
结果发现,有 9 例(13%)在奥希替尼治疗后出现获得性 CDKN2A/MTAP 共缺失(图 2),其中 6 例同时存在其他已知获得性耐药机制:1 例 MET + HER2 扩增;1 例 CCND1 扩增 + 小细胞转化;1 例 EGFR C797S 突变;1 例 EGFR L718Q 突变;1 例 EGFR 扩增;1 例 MDM2/CDK4 扩增。
值得注意的是,在该研究队列中,获得性 CDKN2A/MTAP 共缺失发生率与小细胞转化(13%)相当,且相较 EGFR C797S 突变(7%)更常见。

图 2.(A)奥希替尼治疗耐药时 MTAP 缺失及其他基因变异的发生频率。(B)在 9 例出现获得性 MTAP 缺失患者中所检出的获得性变异情况。
PRMT5 抑制剂用于携带 EGFR 突变和 MTAP-del NSCLC 患者展现治疗潜力
值得一提的是,对于奥希替尼治疗后出现的其他获得性耐药基因变异,如 BRAF V600E、MET 扩增,需要同时靶向耐药机制与潜在驱动基因变异,而 MTAP-del 患者对 PRMT5 抑制剂单药即有应答,彰显了合成致死机制的独特前景。
小结
该研究全面分析了携带 MTAP-del 的 NSCLC 患者的基因组景观,揭示 MTAP-del 相对较常见,常与致癌驱动基因变异共存,并可见于临床病程的不同时间点(包括靶向治疗耐药后)。同时,研究表明,MTAP-del 可通过 PRMT5 抑制剂基于合成致死机制进行靶向干预,即使经多线治疗的驱动基因阳性患者也能取得临床缓解。
展望未来,应进一步探索 PRMT5 抑制与驱动性致癌基因靶向药(如 EGFR-TKI)联合治疗的临床潜力。例如,鉴于部分患者在诊断时即存在 MTAP-del,未来可探索 PRMT5 抑制联合 TKI 用于一线治疗的可行性。
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有效期至:2026-04-22
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参考文献